青雲殿開基，最早是在濱二路23號王清泉師父家宅設有扶鸞儀式，所信奉之神農大帝，村民皆稱神農老帝或神農老祖(相傳清乾隆年間，老帝即藉扶乩降伏雞公精為民除害得以出名)，至今推估應有二百五十餘年歷史。民國49年農曆4月11日，神農大帝指示要蓋廟，威靈顯赫附身主鸞游賴身上，順著神明之指點，一路走在雜草叢生的基隆山上，沿途走至「鷹仔石」峭壁上，躍身跳下百尺深處平地，並以所持寶劍(大劍)插至主鸞腳趾空隙親自點地，分金線絲毫不差，高呼曰：「此地是我駐駕聖址，廟座東朝西，要建三殿，中線左右各伸三十六尺深三十九尺六寸言畢而退駕」，是日信眾數十人皆證實此事。